Les services d’appui sont :

l’Inspection générale de la pêche, de l’aquaculture et de l’économie maritime, le bureau de stratégie et de développement, la division des ressources humaines, la division des affaires financières, le contrôleur financier, la personne responsable des marchés publics, le service genre et équité, le centre de recherche documentation, le service communication et relations publiques, le service de modernisation des systèmes d’information, le service d’accueil et information, le secrétariat central.

Les Directions nationales sont :

la Direction nationale de l’aménagement des pêcheries, la Direction nationale de la pêche maritime, la Direction nationale de la pêche continentale, la Direction nationale de l’économie maritime.

Les services rattachés sont :

le centre d’appui à la pêche et à l’aquaculture, les ports et débarcadères de pêche.

Les projets publics sont :

le projet régional des pêches en Afrique de l’Ouest, le projet pisciculture commerciale et familiale, le projet d’appui au développement de l’aquaculture communautaire en Haute et Moyenne Guinée, le projet d’aménagement du port de pêche artisanale de Kaporo, le projet de protection du grand écosystème marin du courant des Canaris.

Les services déconcentrés sont :

les inspections régionales de la pêche et de l’économie maritime, les directions préfectorales de la pêche et de l’économie maritime, les directions communales de la pêche et de l’économie maritime de la ville de Conakry.

Les organes consultatifs sont : 

le Conseil national pour la pêche, l’aquaculture et l’économie maritime, le Conseil de discipline.